Здається, перший справді національний прапор Самоа був прийнятий 2 жовтня 1873 року. На червоному тлі був білий хрест, що простягався до країв прапора, а також біла зірка у верхньому куті підняття. Символіка невідома, але хрест і зірка, можливо, означали християнство та незалежність відповідно. Король Тамасезе, віддаючи перевагу німцям, які відвідали цю територію, згодом змінив національний прапор, поставивши чорний хрест поверх білого, надавши Самоа німецько-червоно-біло-чорних кольорів. Цей прапор використовувався з 1886 по 1889 рік, але він перестав використовуватися після смерті Тамасесе. Сполучені Штати та Німеччина розділили острови в 1900 році та створили окремі протекторати, де місцеві прапори не заохочувались.
На початку 20 століття колишня територія Німеччини перебувала під управлінням Нової Зеландії. Для цих островів був розроблений місцевий прапор, який відображав прапор Нової Зеландії у його червоно-біло-блакитних кольорах, сузір’ї Південного Хреста та польово-кантонному дизайні. Введений 26 травня 1948 року, новий прапор Самоа був червоним з чотирма білими зірками на блакитному кантоні; 24 лютого 1949 року була додана п'ята зірка. Південний Хрест був популярним прапором у інших країнах Південної півкулі. Його використовують, наприклад, Австралія, Нова Зеландія та Бразилія. У самоанському прапорі білий колір означає чистоту, синій - свободу, червоний - мужність. Коли держава стала незалежною 1 січня 1962 року, національного прапора не було змінено.
